Eğer çok derin ceplere sahipseniz bu durumda daha etkin temizlik yapabilmek ve iltihaplı dokuyu ve diştaşlarını daha etkin şekilde temizleyebilmek için mutlaka flap operasyonlarına gerek duyulur. Böyle durumlarda dişeti kaldırıp altındaki enfekte dokular temizlenip, dişeti tekrar kapatılır. Gerekli duyuluyorsa kemik greftleri kullanılarak ya da hastanın kendine ait kemik parçacıkları kullanılarak kayıp doku telafi edilmeye çalışılır.